Debido a su compleja arquitectura los arrecifes coralinos presentan una gran cantidad de especies asociadas, y los peces son en gran medida los responsables de transferir la energía dentro de las redes tróficas locales y entre biomas colindantes. Por esa razón, el análisis de los factores que determinan la composición de sus asociaciones son relevantes para comprender la dinámica de los sistemas arrecifales. El presente trabajo tuvo como objetivo establecer qué factores del hábitat tienen influencia sobre la composición y distribución de los peces en el arrecife coralino de Cabo Pulmo, B.C.S., México. Se realizaron visitas al sitio en la época cálida (Octubre de 2003) y fría (Febrero de 2004), y se usaron transectos de línea de 25 m para registrar los siguientes descriptores del hábitat: porcentaje de cobertura de roca, arena, coral vivo, coral muerto, y algas; formas coralinas (ramificado o masivo); número de equinodermos (asteroideos, equinoideos y holoturoideos); profundidad máxima a la que se realizo el censo; y rugosidad del fondo. También se hicieron censos de las especies de peces en cilindros de observación de 10 m de diámetro, por 15 minutos (N=18 por época). La estructura de la comunidad se describió con base en la riqueza total (S), el número total de individuos (N), el índice de diversidad de Shannon (H´), el índice de equidad de Pielou (J´) y el índice de diferenciación taxonómica (Δ+), calculados para cada unidad muestral. Se compararon los índices entre las dos épocas analizadas y en dos intervalos de profundidad (>5.5 m y <5.5) con análisis de varianza. En adición, para evaluar si la composición de los ensamblajes fue similar entre épocas y niveles de profundidad se utilizaron análisis de agrupamiento y de escalamiento multi-dimensional no métrico. La influencia que las diferentes variables del hábitat sobre la estructura de la comunidad de peces se determinó por medio de correlaciones de Pearson y regresiones múltiples. Por último, para conocer el efecto de las variables ambientales sobre la abundancia de las especies se utilizó el análisis de correspondencia canónica (ACC). Los resultados indican que ninguno de los descriptores de la comunidad utilizados presentó diferencias entre las dos épocas analizadas; sin embargo, S, N y Δ+ tuvieron valores mayores en la parte profunda del arrecife, y los análisis de ordenación también mostraron diferencias en la composición específica con base en la profundidad, pero no entre las épocas. En relación con el efecto del hábitat sobre la comunidad, se denotó que la profundidad y la abundancia de coral vivo y de corales del género Pocillopora influyen positivamente sobre la mayoría de los descriptores de la estructura comunitaria. Finalmente, aunque el ACC explicó relativamente poca varianza, sus resultados muestran que las especies de peces en el arrecife de Cabo Pulmo están siendo influenciadas de manera conjunta por diversos factores ambientales, y particularmente por la temperatura y la cantidad de coral vivo.
